Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b6P59708 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sf3b6P59708 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b6P59708 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms