Protein–RNA interactions for Protein: P59383

Lrrn4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, mousemouse

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Length 733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4P59383 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrn4P59383 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrn4P59383 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrn4P59383 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrn4P59383 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrn4P59383 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrn4P59383 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrn4P59383 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrn4P59383 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrn4P59383 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrn4P59383 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrn4P59383 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrn4P59383 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrn4P59383 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lrrn4P59383 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrn4P59383 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrn4P59383 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrn4P59383 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrn4P59383 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrn4P59383 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrn4P59383 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrn4P59383 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrn4P59383 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrn4P59383 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrn4P59383 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms