Protein–RNA interactions for Protein: P58771

Tpm1, Tropomyosin alpha-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm1P58771 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Tpm1P58771 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Tpm1P58771 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm1P58771 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms