Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Paxbp1P58501 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Paxbp1P58501 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Paxbp1P58501 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Paxbp1P58501 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Paxbp1P58501 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Paxbp1P58501 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Paxbp1P58501 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Paxbp1P58501 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Paxbp1P58501 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms