Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd4P58467 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Setd4P58467 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd4P58467 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Setd4P58467 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd4P58467 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd4P58467 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Setd4P58467 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Setd4P58467 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Setd4P58467 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd4P58467 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Setd4P58467 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Setd4P58467 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setd4P58467 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Setd4P58467 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms