Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Strn4P58404 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Strn4P58404 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Strn4P58404 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Strn4P58404 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Strn4P58404 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Strn4P58404 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Strn4P58404 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Strn4P58404 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Strn4P58404 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Strn4P58404 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms