Protein–RNA interactions for Protein: P58281

Opa1, Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa1P58281 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opa1P58281 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opa1P58281 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opa1P58281 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opa1P58281 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Opa1P58281 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Opa1P58281 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Opa1P58281 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Opa1P58281 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opa1P58281 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opa1P58281 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Opa1P58281 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Opa1P58281 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Opa1P58281 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Opa1P58281 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Opa1P58281 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Opa1P58281 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Opa1P58281 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Opa1P58281 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Opa1P58281 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Opa1P58281 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Opa1P58281 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Opa1P58281 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Opa1P58281 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Opa1P58281 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Opa1P58281 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Opa1P58281 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Opa1P58281 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Opa1P58281 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Opa1P58281 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Opa1P58281 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Opa1P58281 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Opa1P58281 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Opa1P58281 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms