Protein–RNA interactions for Protein: P57791

Rce1, CAAX prenyl protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rce1P57791 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rce1P57791 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rce1P57791 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rce1P57791 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rce1P57791 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rce1P57791 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rce1P57791 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rce1P57791 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rce1P57791 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rce1P57791 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rce1P57791 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rce1P57791 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rce1P57791 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms