Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Actn4P57780 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Actn4P57780 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Actn4P57780 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Actn4P57780 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Actn4P57780 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Actn4P57780 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Actn4P57780 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Actn4P57780 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Actn4P57780 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Actn4P57780 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Actn4P57780 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Actn4P57780 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Actn4P57780 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn4P57780 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn4P57780 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn4P57780 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn4P57780 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn4P57780 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn4P57780 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn4P57780 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn4P57780 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn4P57780 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn4P57780 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn4P57780 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn4P57780 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Actn4P57780 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actn4P57780 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn4P57780 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn4P57780 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn4P57780 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Actn4P57780 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Actn4P57780 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Actn4P57780 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Actn4P57780 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Actn4P57780 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Actn4P57780 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Actn4P57780 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Actn4P57780 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms