Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NcstnP57716 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NcstnP57716 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NcstnP57716 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NcstnP57716 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NcstnP57716 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NcstnP57716 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NcstnP57716 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NcstnP57716 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NcstnP57716 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NcstnP57716 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NcstnP57716 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NcstnP57716 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NcstnP57716 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms