Protein–RNA interactions for Protein: P57016

Lad1, Ladinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lad1P57016 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lad1P57016 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lad1P57016 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lad1P57016 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lad1P57016 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lad1P57016 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lad1P57016 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lad1P57016 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lad1P57016 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lad1P57016 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lad1P57016 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lad1P57016 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lad1P57016 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lad1P57016 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lad1P57016 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lad1P57016 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lad1P57016 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms