Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Exosc10P56960 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Exosc10P56960 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Exosc10P56960 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Exosc10P56960 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Exosc10P56960 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Exosc10P56960 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Exosc10P56960 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Exosc10P56960 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms