Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1P55194 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp1P55194 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp1P55194 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms