Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcd3P55096 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms