Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ephb3P54754 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ephb3P54754 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ephb3P54754 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ephb3P54754 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ephb3P54754 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ephb3P54754 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ephb3P54754 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ephb3P54754 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ephb3P54754 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ephb3P54754 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ephb3P54754 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ephb3P54754 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ephb3P54754 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ephb3P54754 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ephb3P54754 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ephb3P54754 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ephb3P54754 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ephb3P54754 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ephb3P54754 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ephb3P54754 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ephb3P54754 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ephb3P54754 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ephb3P54754 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ephb3P54754 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ephb3P54754 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ephb3P54754 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ephb3P54754 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ephb3P54754 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ephb3P54754 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ephb3P54754 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ephb3P54754 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ephb3P54754 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ephb3P54754 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ephb3P54754 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ephb3P54754 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ephb3P54754 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ephb3P54754 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ephb3P54754 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ephb3P54754 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ephb3P54754 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ephb3P54754 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ephb3P54754 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ephb3P54754 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ephb3P54754 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ephb3P54754 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ephb3P54754 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ephb3P54754 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ephb3P54754 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ephb3P54754 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ephb3P54754 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ephb3P54754 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ephb3P54754 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms