Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacnb3P54285 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cacnb3P54285 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacnb3P54285 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms