Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rab2aP53994 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab2aP53994 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms