Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Efnb1P52795 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efnb1P52795 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms