Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClgnP52194 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClgnP52194 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClgnP52194 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ClgnP52194 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClgnP52194 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ClgnP52194 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClgnP52194 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms