Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SqleP52019 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SqleP52019 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SqleP52019 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SqleP52019 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SqleP52019 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SqleP52019 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SqleP52019 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SqleP52019 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SqleP52019 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SqleP52019 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SqleP52019 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SqleP52019 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SqleP52019 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SqleP52019 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SqleP52019 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SqleP52019 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SqleP52019 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SqleP52019 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SqleP52019 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SqleP52019 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SqleP52019 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SqleP52019 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SqleP52019 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SqleP52019 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SqleP52019 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SqleP52019 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SqleP52019 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SqleP52019 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SqleP52019 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SqleP52019 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SqleP52019 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SqleP52019 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SqleP52019 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SqleP52019 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SqleP52019 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SqleP52019 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SqleP52019 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SqleP52019 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SqleP52019 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SqleP52019 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SqleP52019 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SqleP52019 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SqleP52019 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SqleP52019 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SqleP52019 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SqleP52019 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SqleP52019 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SqleP52019 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SqleP52019 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SqleP52019 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SqleP52019 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SqleP52019 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SqleP52019 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SqleP52019 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SqleP52019 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SqleP52019 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SqleP52019 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SqleP52019 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SqleP52019 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SqleP52019 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SqleP52019 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SqleP52019 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SqleP52019 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SqleP52019 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SqleP52019 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SqleP52019 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SqleP52019 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SqleP52019 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SqleP52019 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SqleP52019 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SqleP52019 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SqleP52019 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SqleP52019 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SqleP52019 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SqleP52019 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SqleP52019 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SqleP52019 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SqleP52019 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SqleP52019 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SqleP52019 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SqleP52019 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SqleP52019 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SqleP52019 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SqleP52019 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SqleP52019 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SqleP52019 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SqleP52019 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SqleP52019 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SqleP52019 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SqleP52019 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SqleP52019 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SqleP52019 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SqleP52019 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SqleP52019 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SqleP52019 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SqleP52019 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SqleP52019 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SqleP52019 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SqleP52019 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms