Protein–RNA interactions for Protein: P51675

Ccr1, C-C chemokine receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr1P51675 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms