Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FmodP50608 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FmodP50608 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FmodP50608 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FmodP50608 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FmodP50608 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FmodP50608 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FmodP50608 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FmodP50608 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FmodP50608 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FmodP50608 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FmodP50608 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FmodP50608 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FmodP50608 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FmodP50608 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FmodP50608 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FmodP50608 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FmodP50608 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FmodP50608 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FmodP50608 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FmodP50608 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FmodP50608 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FmodP50608 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FmodP50608 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FmodP50608 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FmodP50608 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FmodP50608 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FmodP50608 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FmodP50608 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FmodP50608 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FmodP50608 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FmodP50608 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FmodP50608 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FmodP50608 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FmodP50608 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FmodP50608 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FmodP50608 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FmodP50608 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FmodP50608 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FmodP50608 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FmodP50608 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FmodP50608 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FmodP50608 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FmodP50608 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FmodP50608 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FmodP50608 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FmodP50608 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FmodP50608 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FmodP50608 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FmodP50608 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FmodP50608 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FmodP50608 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FmodP50608 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FmodP50608 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FmodP50608 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FmodP50608 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FmodP50608 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FmodP50608 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FmodP50608 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FmodP50608 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FmodP50608 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FmodP50608 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FmodP50608 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FmodP50608 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FmodP50608 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FmodP50608 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FmodP50608 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FmodP50608 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FmodP50608 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FmodP50608 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FmodP50608 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FmodP50608 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FmodP50608 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FmodP50608 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FmodP50608 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FmodP50608 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FmodP50608 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FmodP50608 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FmodP50608 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FmodP50608 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FmodP50608 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FmodP50608 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FmodP50608 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FmodP50608 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FmodP50608 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FmodP50608 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FmodP50608 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FmodP50608 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FmodP50608 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FmodP50608 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FmodP50608 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FmodP50608 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FmodP50608 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FmodP50608 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FmodP50608 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FmodP50608 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FmodP50608 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FmodP50608 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FmodP50608 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FmodP50608 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms