Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx3P48759 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms