Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prox1P48437 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prox1P48437 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prox1P48437 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prox1P48437 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prox1P48437 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prox1P48437 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prox1P48437 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prox1P48437 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prox1P48437 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prox1P48437 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prox1P48437 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms