Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rfx2P48379 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rfx2P48379 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rfx2P48379 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms