Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccl11P48298 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl11P48298 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms