Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl5P47962 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl5P47962 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl5P47962 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl5P47962 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl5P47962 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms