Protein–RNA interactions for Protein: P46471

Psmc2, 26S proteasome regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc2P46471 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmc2P46471 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmc2P46471 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmc2P46471 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms