Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlx1P43345 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tlx1P43345 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms