Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtgfrP43117 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtgfrP43117 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtgfrP43117 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms