Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TtlP38585 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TtlP38585 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TtlP38585 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TtlP38585 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TtlP38585 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TtlP38585 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TtlP38585 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TtlP38585 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TtlP38585 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TtlP38585 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TtlP38585 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TtlP38585 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TtlP38585 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TtlP38585 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TtlP38585 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TtlP38585 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TtlP38585 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TtlP38585 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TtlP38585 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TtlP38585 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TtlP38585 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TtlP38585 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TtlP38585 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TtlP38585 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TtlP38585 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TtlP38585 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TtlP38585 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TtlP38585 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TtlP38585 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TtlP38585 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TtlP38585 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TtlP38585 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TtlP38585 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TtlP38585 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TtlP38585 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TtlP38585 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TtlP38585 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TtlP38585 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TtlP38585 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TtlP38585 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TtlP38585 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TtlP38585 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TtlP38585 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TtlP38585 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TtlP38585 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TtlP38585 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TtlP38585 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TtlP38585 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TtlP38585 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TtlP38585 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TtlP38585 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TtlP38585 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TtlP38585 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TtlP38585 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TtlP38585 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TtlP38585 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TtlP38585 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TtlP38585 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TtlP38585 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TtlP38585 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TtlP38585 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TtlP38585 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TtlP38585 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TtlP38585 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TtlP38585 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TtlP38585 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TtlP38585 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TtlP38585 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TtlP38585 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TtlP38585 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TtlP38585 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TtlP38585 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TtlP38585 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TtlP38585 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TtlP38585 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TtlP38585 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TtlP38585 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TtlP38585 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TtlP38585 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TtlP38585 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TtlP38585 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TtlP38585 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TtlP38585 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TtlP38585 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TtlP38585 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TtlP38585 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TtlP38585 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TtlP38585 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TtlP38585 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TtlP38585 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TtlP38585 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TtlP38585 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TtlP38585 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TtlP38585 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TtlP38585 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TtlP38585 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TtlP38585 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TtlP38585 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TtlP38585 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms