Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PpargP37238 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PpargP37238 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PpargP37238 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PpargP37238 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PpargP37238 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PpargP37238 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PpargP37238 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PpargP37238 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PpargP37238 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PpargP37238 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PpargP37238 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PpargP37238 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PpargP37238 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PpargP37238 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PpargP37238 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PpargP37238 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PpargP37238 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PpargP37238 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PpargP37238 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PpargP37238 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PpargP37238 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PpargP37238 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpargP37238 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpargP37238 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpargP37238 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpargP37238 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpargP37238 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpargP37238 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpargP37238 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PpargP37238 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PpargP37238 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PpargP37238 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PpargP37238 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PpargP37238 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PpargP37238 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PpargP37238 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PpargP37238 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PpargP37238 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PpargP37238 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PpargP37238 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PpargP37238 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PpargP37238 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PpargP37238 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PpargP37238 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PpargP37238 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpargP37238 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpargP37238 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpargP37238 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpargP37238 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpargP37238 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpargP37238 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpargP37238 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpargP37238 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpargP37238 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpargP37238 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpargP37238 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpargP37238 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpargP37238 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpargP37238 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpargP37238 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PpargP37238 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PpargP37238 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PpargP37238 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PpargP37238 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PpargP37238 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PpargP37238 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PpargP37238 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PpargP37238 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PpargP37238 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PpargP37238 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PpargP37238 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PpargP37238 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PpargP37238 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PpargP37238 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PpargP37238 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PpargP37238 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PpargP37238 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PpargP37238 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PpargP37238 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PpargP37238 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PpargP37238 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PpargP37238 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpargP37238 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpargP37238 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpargP37238 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpargP37238 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpargP37238 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpargP37238 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpargP37238 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpargP37238 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpargP37238 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpargP37238 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpargP37238 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpargP37238 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpargP37238 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpargP37238 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpargP37238 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpargP37238 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PpargP37238 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms