Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PtprkP35822 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PtprkP35822 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PtprkP35822 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PtprkP35822 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PtprkP35822 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PtprkP35822 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PtprkP35822 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PtprkP35822 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PtprkP35822 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PtprkP35822 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PtprkP35822 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PtprkP35822 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PtprkP35822 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms