Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddit3P35639 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddit3P35639 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddit3P35639 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms