Protein–RNA interactions for Protein: P35492

Hal, Histidine ammonia-lyase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HalP35492 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HalP35492 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HalP35492 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HalP35492 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HalP35492 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HalP35492 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HalP35492 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HalP35492 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HalP35492 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HalP35492 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HalP35492 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HalP35492 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HalP35492 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HalP35492 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HalP35492 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HalP35492 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HalP35492 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HalP35492 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HalP35492 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HalP35492 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HalP35492 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HalP35492 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HalP35492 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HalP35492 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HalP35492 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HalP35492 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HalP35492 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HalP35492 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HalP35492 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HalP35492 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HalP35492 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HalP35492 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HalP35492 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HalP35492 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HalP35492 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HalP35492 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HalP35492 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HalP35492 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HalP35492 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HalP35492 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HalP35492 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HalP35492 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HalP35492 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HalP35492 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HalP35492 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HalP35492 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HalP35492 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HalP35492 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HalP35492 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HalP35492 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HalP35492 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HalP35492 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HalP35492 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HalP35492 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HalP35492 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HalP35492 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HalP35492 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HalP35492 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HalP35492 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HalP35492 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HalP35492 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HalP35492 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HalP35492 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HalP35492 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HalP35492 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HalP35492 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HalP35492 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HalP35492 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HalP35492 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HalP35492 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HalP35492 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HalP35492 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HalP35492 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HalP35492 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HalP35492 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HalP35492 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HalP35492 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HalP35492 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HalP35492 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HalP35492 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HalP35492 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HalP35492 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HalP35492 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HalP35492 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HalP35492 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HalP35492 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HalP35492 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HalP35492 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HalP35492 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HalP35492 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HalP35492 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HalP35492 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HalP35492 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HalP35492 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HalP35492 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HalP35492 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HalP35492 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HalP35492 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HalP35492 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HalP35492 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms