Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5cP35278 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5cP35278 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms