Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stfa1P35175 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stfa1P35175 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stfa1P35175 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stfa1P35175 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stfa1P35175 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stfa1P35175 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stfa1P35175 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Stfa1P35175 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Stfa1P35175 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stfa1P35175 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stfa1P35175 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stfa1P35175 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms