Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ifnar1P33896 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms