Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc3P33622 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc3P33622 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms