Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh15P33146 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdh15P33146 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh15P33146 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms