Protein–RNA interactions for Protein: P32883

Kras, GTPase KRas, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KrasP32883 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KrasP32883 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KrasP32883 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KrasP32883 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KrasP32883 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KrasP32883 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KrasP32883 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KrasP32883 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KrasP32883 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KrasP32883 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KrasP32883 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KrasP32883 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KrasP32883 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KrasP32883 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KrasP32883 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KrasP32883 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KrasP32883 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KrasP32883 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KrasP32883 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KrasP32883 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KrasP32883 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KrasP32883 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KrasP32883 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KrasP32883 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KrasP32883 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KrasP32883 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KrasP32883 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KrasP32883 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KrasP32883 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KrasP32883 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KrasP32883 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KrasP32883 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KrasP32883 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KrasP32883 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KrasP32883 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KrasP32883 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KrasP32883 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KrasP32883 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KrasP32883 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KrasP32883 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KrasP32883 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KrasP32883 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KrasP32883 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KrasP32883 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KrasP32883 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KrasP32883 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KrasP32883 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KrasP32883 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KrasP32883 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KrasP32883 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KrasP32883 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KrasP32883 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KrasP32883 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KrasP32883 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KrasP32883 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KrasP32883 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KrasP32883 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KrasP32883 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KrasP32883 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KrasP32883 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KrasP32883 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KrasP32883 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KrasP32883 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KrasP32883 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KrasP32883 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KrasP32883 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KrasP32883 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KrasP32883 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KrasP32883 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KrasP32883 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KrasP32883 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KrasP32883 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KrasP32883 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KrasP32883 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KrasP32883 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KrasP32883 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KrasP32883 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KrasP32883 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KrasP32883 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KrasP32883 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KrasP32883 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KrasP32883 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KrasP32883 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KrasP32883 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KrasP32883 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KrasP32883 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KrasP32883 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KrasP32883 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KrasP32883 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KrasP32883 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KrasP32883 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KrasP32883 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KrasP32883 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KrasP32883 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KrasP32883 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KrasP32883 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KrasP32883 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KrasP32883 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KrasP32883 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KrasP32883 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms