Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxc11P31313 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms