Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk4P30285 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk4P30285 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk4P30285 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk4P30285 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk4P30285 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms