Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OatP29758 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
OatP29758 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OatP29758 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
OatP29758 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OatP29758 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
OatP29758 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OatP29758 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OatP29758 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OatP29758 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OatP29758 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OatP29758 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OatP29758 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OatP29758 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OatP29758 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OatP29758 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OatP29758 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OatP29758 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OatP29758 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OatP29758 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OatP29758 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OatP29758 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OatP29758 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OatP29758 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OatP29758 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OatP29758 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OatP29758 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OatP29758 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OatP29758 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OatP29758 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OatP29758 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OatP29758 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OatP29758 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OatP29758 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OatP29758 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OatP29758 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OatP29758 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OatP29758 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OatP29758 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OatP29758 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OatP29758 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OatP29758 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OatP29758 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OatP29758 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OatP29758 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OatP29758 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OatP29758 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OatP29758 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OatP29758 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OatP29758 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OatP29758 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OatP29758 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OatP29758 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OatP29758 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OatP29758 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OatP29758 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OatP29758 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OatP29758 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OatP29758 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OatP29758 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OatP29758 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OatP29758 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OatP29758 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
OatP29758 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OatP29758 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OatP29758 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OatP29758 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OatP29758 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OatP29758 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OatP29758 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OatP29758 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OatP29758 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
OatP29758 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OatP29758 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OatP29758 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OatP29758 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OatP29758 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OatP29758 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OatP29758 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OatP29758 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
OatP29758 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OatP29758 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OatP29758 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OatP29758 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OatP29758 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OatP29758 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OatP29758 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OatP29758 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OatP29758 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OatP29758 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OatP29758 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OatP29758 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
OatP29758 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OatP29758 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OatP29758 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OatP29758 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OatP29758 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OatP29758 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OatP29758 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OatP29758 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms