Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp3P28862 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Mmp3P28862 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp3P28862 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms