Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RxraP28700 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RxraP28700 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RxraP28700 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RxraP28700 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RxraP28700 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RxraP28700 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RxraP28700 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RxraP28700 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RxraP28700 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RxraP28700 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RxraP28700 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RxraP28700 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RxraP28700 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RxraP28700 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RxraP28700 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RxraP28700 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RxraP28700 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RxraP28700 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RxraP28700 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RxraP28700 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RxraP28700 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RxraP28700 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RxraP28700 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RxraP28700 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RxraP28700 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RxraP28700 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RxraP28700 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RxraP28700 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RxraP28700 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RxraP28700 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RxraP28700 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RxraP28700 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RxraP28700 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RxraP28700 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RxraP28700 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RxraP28700 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RxraP28700 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RxraP28700 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RxraP28700 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RxraP28700 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RxraP28700 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RxraP28700 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RxraP28700 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RxraP28700 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RxraP28700 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RxraP28700 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RxraP28700 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RxraP28700 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RxraP28700 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RxraP28700 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RxraP28700 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RxraP28700 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RxraP28700 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RxraP28700 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RxraP28700 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RxraP28700 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RxraP28700 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RxraP28700 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RxraP28700 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RxraP28700 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RxraP28700 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RxraP28700 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RxraP28700 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RxraP28700 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RxraP28700 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RxraP28700 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RxraP28700 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RxraP28700 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RxraP28700 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RxraP28700 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RxraP28700 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RxraP28700 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RxraP28700 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RxraP28700 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RxraP28700 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RxraP28700 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RxraP28700 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RxraP28700 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RxraP28700 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RxraP28700 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RxraP28700 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RxraP28700 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RxraP28700 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RxraP28700 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RxraP28700 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RxraP28700 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RxraP28700 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RxraP28700 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RxraP28700 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RxraP28700 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RxraP28700 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RxraP28700 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RxraP28700 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RxraP28700 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RxraP28700 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RxraP28700 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RxraP28700 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RxraP28700 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RxraP28700 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms