Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NapbP28663 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NapbP28663 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NapbP28663 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NapbP28663 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NapbP28663 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NapbP28663 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NapbP28663 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NapbP28663 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NapbP28663 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NapbP28663 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NapbP28663 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NapbP28663 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NapbP28663 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NapbP28663 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NapbP28663 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NapbP28663 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NapbP28663 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NapbP28663 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NapbP28663 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NapbP28663 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NapbP28663 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NapbP28663 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NapbP28663 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NapbP28663 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NapbP28663 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NapbP28663 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NapbP28663 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NapbP28663 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NapbP28663 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NapbP28663 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NapbP28663 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NapbP28663 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NapbP28663 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NapbP28663 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NapbP28663 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NapbP28663 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NapbP28663 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NapbP28663 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NapbP28663 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NapbP28663 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NapbP28663 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NapbP28663 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NapbP28663 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NapbP28663 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NapbP28663 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NapbP28663 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NapbP28663 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NapbP28663 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NapbP28663 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NapbP28663 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NapbP28663 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NapbP28663 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NapbP28663 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NapbP28663 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NapbP28663 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NapbP28663 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NapbP28663 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NapbP28663 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NapbP28663 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NapbP28663 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NapbP28663 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NapbP28663 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NapbP28663 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NapbP28663 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NapbP28663 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NapbP28663 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NapbP28663 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NapbP28663 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NapbP28663 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NapbP28663 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NapbP28663 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NapbP28663 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NapbP28663 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NapbP28663 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NapbP28663 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NapbP28663 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NapbP28663 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NapbP28663 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NapbP28663 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NapbP28663 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NapbP28663 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NapbP28663 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NapbP28663 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NapbP28663 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NapbP28663 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NapbP28663 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NapbP28663 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NapbP28663 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NapbP28663 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NapbP28663 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NapbP28663 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NapbP28663 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NapbP28663 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NapbP28663 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NapbP28663 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NapbP28663 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NapbP28663 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NapbP28663 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NapbP28663 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms