Protein–RNA interactions for Protein: P28575

Ipp, Actin-binding protein IPP, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IppP28575 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IppP28575 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IppP28575 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IppP28575 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IppP28575 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IppP28575 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IppP28575 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IppP28575 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IppP28575 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IppP28575 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IppP28575 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IppP28575 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IppP28575 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IppP28575 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IppP28575 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IppP28575 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IppP28575 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IppP28575 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IppP28575 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IppP28575 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IppP28575 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IppP28575 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IppP28575 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IppP28575 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IppP28575 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IppP28575 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IppP28575 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IppP28575 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IppP28575 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IppP28575 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IppP28575 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IppP28575 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IppP28575 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IppP28575 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IppP28575 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IppP28575 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IppP28575 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IppP28575 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IppP28575 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IppP28575 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IppP28575 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IppP28575 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IppP28575 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IppP28575 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IppP28575 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IppP28575 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IppP28575 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
IppP28575 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IppP28575 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IppP28575 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IppP28575 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IppP28575 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IppP28575 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IppP28575 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IppP28575 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IppP28575 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IppP28575 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IppP28575 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IppP28575 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IppP28575 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IppP28575 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IppP28575 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IppP28575 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IppP28575 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IppP28575 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IppP28575 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IppP28575 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IppP28575 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IppP28575 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IppP28575 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IppP28575 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IppP28575 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IppP28575 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IppP28575 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IppP28575 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IppP28575 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IppP28575 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IppP28575 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IppP28575 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IppP28575 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IppP28575 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IppP28575 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IppP28575 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IppP28575 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IppP28575 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IppP28575 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IppP28575 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IppP28575 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IppP28575 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IppP28575 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IppP28575 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IppP28575 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IppP28575 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IppP28575 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IppP28575 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IppP28575 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IppP28575 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IppP28575 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
IppP28575 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IppP28575 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208.1 ms