Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja4P28235 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja4P28235 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja4P28235 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja4P28235 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja4P28235 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja4P28235 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gja4P28235 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja4P28235 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja4P28235 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms