Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xrcc5P27641 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xrcc5P27641 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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